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把一次性PCR擴增可以設(shè)置一系列不同的退火溫度條件(溫度梯度),通常有12種溫度梯度,這樣的儀器就叫梯度PCR儀。因為被擴增的不同DNA片段,其退火溫度事不同,通過設(shè)置一系列的梯度退火溫度進行擴增,從而一次性PCR擴增,就可以篩選出表達量高的退火溫度,進行有效的擴增。主要用于研究未知DNA退火溫度的擴增,這樣節(jié)約成本的同時也節(jié)約了時間。主要用于科研,教學(xué)機構(gòu)。梯度PCR儀,在不設(shè)置梯度的情況下也可以做普通PCR擴增。